С этого можно было начинать...
Двухлетками можно и под бур сажать, главное - не промахнуться с уровнем корневой шейки у саженцев. У яблони подвои будут, скорее всего, полукарлики и она переживёт некоторое заглубление, остальное постарайтесь посадить на 5-7 см выше, грунт позже осядет и всё будет как нужно. В Вашем случае надо больше озаботиться поливом будущего сада и мульчированием посадок. Других проблем не вижу.