Понятно, что дело не в зимостойкости - коли гибнут посевы текущего года.
Какую почву Вы используете?
Я сеяла сосны в плошки, потом пикировала в горшочки. Некоторые до сих пор растут в горшках

Но почва в горшках бедная, с большим количеством песка, чуть побогаче делала - сразу начинался отпад (правда, в основном пятихвойных, пондерозы и горные неубиваемые).
С. юньнаньской, судя по Вики, нужна бедная почва:
Хорошо растёт на малоплодородных, неглубоких и каменистых почвах и выдерживает сильные морозы на больших высотах.
Так что, если почва побогаче или содержит торф, да еще при регулярном поливе - скорее всего загнивают корни.